根據文獻記載，距今約六五○○年前的海侵時期到荷蘭時期，南台灣的西海岸線內分佈著幾處面積廣大的內海（或稱潟湖），海岸線外也有成群羅列的砂洲。
「蚊佳半島」正是其中之一，半島形狀狹長，面積由台南、麻豆、佳里興延伸到嘉義布袋的虎尾尞，四百年前荷蘭人稱這半島為「兩河之地」，而麻豆
就座落在蚊佳半島之間，地理位置非常重要。
蚊佳半島的兩側即鼎鼎有名兩個內海，北邊是倒風內海，南邊則是的臺江內海。
清康熙末期所纂的《諸羅縣志》〈山川總圖繪記〉中的總圖即繪有這樣的情形，
自臺南縣迆頭港，經洲仔尾、灣港口、直加弄、管寮、西港、含西港、桌加、漚汪溪口，北伸延至蚊港青峰闕。
西邊為青鯤鯓嶼、馬沙溝嶼、北門嶼等嶼及其外圍為南北鯤鯓沙線，與臺南市西邊的海翁嶼、隙仔、北線尾，接連安平南邊的七鯤鯓，
形勢如貫珠般的沙線而成臺江內海。
有許多小河流的 河水流入內海，這些流入內海的河流叫「海汊港」。
考古學家調查結果發現，許多史前文 化遺址分布在「海汊港」較高較平坦的河岸。
較有名的「海汊港」，在「臺江內海」有含西港海汊（七股寮溪）、灣港海汊（安順寮溪）、新 港海汊（大洲溪）、大橋港海汊（柴頭港溪）等，
都有密集的史前文化遺址分布。
清道光年間以前，沿著現在的將軍區山子腳西邊（古歐汪溪出海口）、七股區篤加（古卓加港），西港區蚶西港（古含西港）、西港區西港（古西港仔港 ）
、安定區管寮（古菅寮港）、安定區安定（古直加弄港）、安定區港口（灣港 口，亦即目加溜灣港的港口）、永康區洲仔尾（古洲仔尾）、台南市市區（歷郡城）
、台南市南郊鹽埕南邊等地，是當時的內陸海岸線…..
海岸線的外面，從南邊 的二層行溪，到北邊的安平鎮就有七鯤鯓（一鯤鯓即安平鎮、二鯤鯓即今億載金 城、三鯤鯓就是現在的億載金城南邊對岸處、
四鯤鯓就是現在的下鯤鯓、五鯤鯓就是現在的台南市喜樹、七鯤鯓就是現在的台南市灣裡）；其中，由二層行溪到 喜樹間的內海稱為喜樹港，喜樹港的北邊
有北線尾島，該島與安平鎮之間稱為大 港（大貝港的簡稱，又稱南口），北線尾島的北邊有隙仔嶼，北線尾島與隙仔嶼 之間的隙口稱為鹿耳門港（又稱北口）
，而北線尾島東邊沿島的內海稱為北線尾 港，
在隙仔嶼的北邊到現今台南縣與嘉義縣界之間，還有加老灣、青鯤鯓、馬沙 溝、青峰闕、海翁汕、北門嶼與南北鯤鯓等沙嶼。
這一大片由內陸海岸線與離岸沙嶼所圍成的水域，就是古稱的「臺江內海」 。
《諸 羅縣志》卷一封域志山川條的記載：
「麻豆之南曰灣裏溪，發源於噍吧哖內山……南合烏山頭之流，過赤山，至於灣裏，過蘇厝甲、檨仔林、蕭壠，西出為歐汪 溪。」
續修《台灣府志》卷一封域志山川條的記載：
「諸羅縣灣裏溪，在 縣治南七十里，源自於噍吧哖社內山，南過大武壠山合卓猴山之流，逕石仔瀨， 過赤山出歐汪溪入海。」
其中的灣裡溪就是現在的曾文溪 ，而它的下游在清初時是經由歐汪溪（現在的將軍溪）入海的。
道光三年（1823）七月間，因連日豪雨，山洪暴發，
使得原來流經蘇 厝甲與檨仔林間，北轉蕭壠社，由漚汪西流入海的灣裡溪挾帶內山崩陷的泥沙， 決堤改道經管寮向西，主流由鹿耳門流
注入臺江內海，支流在鹿耳門東邊向南， 由安平角大港口入海。
姚瑩所著《東槎紀略》提到了這場 大風雨以及台江內海的陸浮情形：
「道光三年七月台灣大風雨、鹿耳門內海沙驟 長變為陸地……，十月以後北自嘉義之曾文，南至郡城之小北門外四十餘里，東自洲仔尾 海岸，
西至鹿耳門內十五六里，瀰漫浩瀚之區，忽已水涸沙高變為陸埔….. 。」
道光年間曾文溪改道後，在原臺江內海的中間區段（內海最廣闊的部份）老加灣港附近，形成一個新的港口，取代被淤廢的鹿耳門港，
成為郡城進出的門戶 ，稱為國聖港、或稱國賽港、國使港、各西港。
依記載，國賽港是當時台灣島內 ，除了北部的雞籠（現在的基隆港）外，較深的港口，它的位置大約在原臺江內 海的殘留部份，
也就是三股溪、七股溪、西寮西邊一帶的內海，而國賽港口就在 現在三股溪與七股溪口之間的沙洲闕口。
滄海桑田，臺江內海淤積陸浮、國賽港口的遺跡已不再，
現在的七股潟湖正是當時臺江內海留存的一部份。
原臺江內海淤積後，最普遍的用途是闢為魚塭。
台南市政府則於1980年代開發第五期重劃區，填平魚塭及遷移市政府至此後，目前已成一片市區至億載金城為止。
台江內海較大的遺跡只剩下是四草湖及鯤鯓湖。
前者匯流鹽水溪、竹筏港、運鹽古運河、嘉南大排等河川，在安平及北汕尾之間出海，也是昔日安平舊港的所在地；
後者則於戰後改建成為安平新港。
正所謂滄海桑田 ……
